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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados; Embrapa Soja. |
Data corrente: |
07/02/2017 |
Data da última atualização: |
26/07/2017 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SOUZA, R. C.; MENDES, I. C.; REIS-JUNIOR, F. B.; CARVALHO, F. M.; NOGUEIRA, M. A.; VASCONCELOS, A. T. R.; VICENTE, V. A.; HUNGRIA, M. |
Afiliação: |
MARCO ANTONIO NOGUEIRA, CNPSO; MARIANGELA HUNGRIA DA CUNHA, CNPSO. |
Título: |
Shifts in taxonomic and functional microbial diversity with agriculture: How fragile is the Brazilian Cerrado? |
Ano de publicação: |
2016 |
Fonte/Imprenta: |
BMC Microbiology, [S. l.], v. 16, n. 42, 2016. 15 p. |
Idioma: |
Inglês Português |
Conteúdo: |
Abstract: Background: The Cerrado ? an edaphic type of savannah ? comprises the second largest biome of the Brazilian territory and is the main area for grain production in the country, but information about the impact of land conversion to agriculture on microbial diversity is still scarce. We used a shotgun metagenomic approach to compare undisturbed (native) soil and soils cropped for 23 years with soybean/maize under conservation tillage ? ?no-till? (NT) ? and conventional tillage (CT) systems in the Cerrado biome. Results: Soil management and fertilizer inputs with the introduction of agriculture improved chemical properties, but decreased soil macroporosity and microbial biomass of carbon and nitrogen. Principal coordinates analyses confirmed different taxonomic and functional profiles for each treatment. There was predominance of the Bacteria domain, especially the phylum Proteobacteria, with higher numbers of sequences in the NT and CT treatments; Archaea and Viruses also had lower numbers of sequences in the undisturbed soil. Within the Alphaproteobacteria, there was dominance of Rhizobiales and of the genus Bradyrhizobium in the NT and CT systems, attributed to massive inoculation of soybean, and also of Burkholderiales. In contrast, Rhizobium, Azospirillum, Xanthomonas, Pseudomonas and Acidobacterium predominated in the native Cerrado. More Eukaryota, especially of the phylum Ascomycota were detected in the NT. The functional analysis revealed lower numbers of sequences in the five dominant categories for the CT system, whereas the undisturbed Cerrado presented higher abundance. Conclusion: High impact of agriculture in taxonomic and functional microbial diversity in the biome Cerrado was confirmed. Functional diversity was not necessarily associated with taxonomic diversity, as the less conservationist treatment (CT) presented increased taxonomic sequences and reduced functional profiles, indicating a strategy to try to maintain soil functioning by favoring taxa that are probably not the most efficient for some functions. Our results highlight that underneath the rustic appearance of the Cerrado vegetation there is a fragile soil microbial community. MenosAbstract: Background: The Cerrado ? an edaphic type of savannah ? comprises the second largest biome of the Brazilian territory and is the main area for grain production in the country, but information about the impact of land conversion to agriculture on microbial diversity is still scarce. We used a shotgun metagenomic approach to compare undisturbed (native) soil and soils cropped for 23 years with soybean/maize under conservation tillage ? ?no-till? (NT) ? and conventional tillage (CT) systems in the Cerrado biome. Results: Soil management and fertilizer inputs with the introduction of agriculture improved chemical properties, but decreased soil macroporosity and microbial biomass of carbon and nitrogen. Principal coordinates analyses confirmed different taxonomic and functional profiles for each treatment. There was predominance of the Bacteria domain, especially the phylum Proteobacteria, with higher numbers of sequences in the NT and CT treatments; Archaea and Viruses also had lower numbers of sequences in the undisturbed soil. Within the Alphaproteobacteria, there was dominance of Rhizobiales and of the genus Bradyrhizobium in the NT and CT systems, attributed to massive inoculation of soybean, and also of Burkholderiales. In contrast, Rhizobium, Azospirillum, Xanthomonas, Pseudomonas and Acidobacterium predominated in the native Cerrado. More Eukaryota, especially of the phylum Ascomycota were detected in the NT. The functional analysis revealed lower numbers of seq... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Biodiversidade funcional; Metagenoma shotgun; Microbioma do solo; Seuqenciamento shotgun. |
Thesagro: |
Cerrado; Manejo do Solo; Microbiologia do Solo; Plantio Direto; Solo. |
Thesaurus Nal: |
Microbiome. |
Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra S Ciências Biológicas |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/155220/1/Souza-BMC.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/154849/1/Souza-et-al-2016-Shifts-in-diversity.pdf
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Marc: |
LEADER 03156naa a2200325 a 4500 001 2063376 005 2017-07-26 008 2016 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aSOUZA, R. C. 245 $aShifts in taxonomic and functional microbial diversity with agriculture$bHow fragile is the Brazilian Cerrado?$h[electronic resource] 260 $c2016 520 $aAbstract: Background: The Cerrado ? an edaphic type of savannah ? comprises the second largest biome of the Brazilian territory and is the main area for grain production in the country, but information about the impact of land conversion to agriculture on microbial diversity is still scarce. We used a shotgun metagenomic approach to compare undisturbed (native) soil and soils cropped for 23 years with soybean/maize under conservation tillage ? ?no-till? (NT) ? and conventional tillage (CT) systems in the Cerrado biome. Results: Soil management and fertilizer inputs with the introduction of agriculture improved chemical properties, but decreased soil macroporosity and microbial biomass of carbon and nitrogen. Principal coordinates analyses confirmed different taxonomic and functional profiles for each treatment. There was predominance of the Bacteria domain, especially the phylum Proteobacteria, with higher numbers of sequences in the NT and CT treatments; Archaea and Viruses also had lower numbers of sequences in the undisturbed soil. Within the Alphaproteobacteria, there was dominance of Rhizobiales and of the genus Bradyrhizobium in the NT and CT systems, attributed to massive inoculation of soybean, and also of Burkholderiales. In contrast, Rhizobium, Azospirillum, Xanthomonas, Pseudomonas and Acidobacterium predominated in the native Cerrado. More Eukaryota, especially of the phylum Ascomycota were detected in the NT. The functional analysis revealed lower numbers of sequences in the five dominant categories for the CT system, whereas the undisturbed Cerrado presented higher abundance. Conclusion: High impact of agriculture in taxonomic and functional microbial diversity in the biome Cerrado was confirmed. Functional diversity was not necessarily associated with taxonomic diversity, as the less conservationist treatment (CT) presented increased taxonomic sequences and reduced functional profiles, indicating a strategy to try to maintain soil functioning by favoring taxa that are probably not the most efficient for some functions. Our results highlight that underneath the rustic appearance of the Cerrado vegetation there is a fragile soil microbial community. 650 $aMicrobiome 650 $aCerrado 650 $aManejo do Solo 650 $aMicrobiologia do Solo 650 $aPlantio Direto 650 $aSolo 653 $aBiodiversidade funcional 653 $aMetagenoma shotgun 653 $aMicrobioma do solo 653 $aSeuqenciamento shotgun 700 1 $aMENDES, I. C. 700 1 $aREIS-JUNIOR, F. B. 700 1 $aCARVALHO, F. M. 700 1 $aNOGUEIRA, M. A. 700 1 $aVASCONCELOS, A. T. R. 700 1 $aVICENTE, V. A. 700 1 $aHUNGRIA, M. 773 $tBMC Microbiology, [S. l.]$gv. 16, n. 42, 2016. 15 p.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Registros recuperados : 44 | |
5. | | CARVALHO, F. M.; SOUZA, R. C.; BARCELLOS, F. G.; HUNGRIA, M.; VASCONCELOS, A. T. R. Genomic and evolutionary comparisons of diazotrophic and pathogenic bacteria of the order Rhizobiales. BMC Microbiology, London, v. 10, n. 37, p. 1-15, Feb. 2010.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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7. | | SOUZA, R. C. de; CANTÃO, M. E.; NOGUEIRA, M. A.; VASCONCELOS, A. T. R.; NICOLAS, M. F.; HUNGRIA, M. Biodiversidade de procariotos em solo sob plantio direto e plantio convencional em rotação ou sucessão de culturas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBILOGIA, 26.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE BACTÉRIAS LÁTICAS; ENCONTRO NACIONAL DE PROFESSORES DE MICROBIOLOGIA; SIMPÓSIO DE COLEÇÕES DE CULTURAS, 4., 2011, Foz do Iguaçu. Anais... São Paulo: SBM, 2011. Resumo, 365-1.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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8. | | SIQUEIRA, A. F.; NAKATANI, A. S.; VASCONCELOS, A. T. R. de; ALMEIDA, L. G. P. de; HUNGRIA, M. Anotação Genômica de Bradyrhizobium japonicum estirpes CPAC 15 e CPAC 7: Resultados parciais e sua importância para a cultura de soja. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 30.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 14.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 12.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 9.; SIMPÓSIO SOBRE SELÊNIO NO BRASIL, 1., 2012, Maceió. A responsabilidade socioambiental da pesquisa agrícola: anais. Viçosa: SBCS, 2012. 3 p. Trab. 1190. 1 CD-ROM. Fertbio.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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10. | | CARVALHO, F. M.; GOMES, D. F.; ORTIZ, M.; ALMEIDA, L. G.; SOUSA, R. C.; VASCONCELOS, A. T. R.; HUNGRIA, M. Genomic panorama, focused on the symbiotic context, of bradyrhizobium elkanii strains semia 587, semia 5019 and usda 76t (t é sobrescrito). In: REUNIÃO LATINOAMERICANA DE RIZOBIOLOGIA - RELAR, 27., 2016, Londrina. Fortalecendo as parcerias Sul-Sul: anais. Curitiba: SBCS-NEPAR, 2016. p. 178. Editores: Mariangela Hungria, Douglas Fabiano Gomes, Arnaldo Colozzi Filho.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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12. | | HUNGRIA, M.; NICOLAS, M. F.; GUIMARAES, C. T.; JARDIM, S. N.; GOMES, E. A.; VASCONCELOS, A. T. R. de. Tolerance to stress and environmental adaptability of Chromobacterium violaceum. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 3, n. 1, p. 102-116, 2004.Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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13. | | MEDEIROS, J. D.; CANTAO, M. E.; CESAR, D. E.; NICOLÁS, M. F.; DINIZ, C. G.; SILVA, V. L.; VASCONCELOS, A. T. R. de; COELHO, C. M. Comparative metagenome of a stream impacted by the urbanization phenomenon. Brazilian Journal of Microbiology, São Paulo, SP, v. 47, n. 4, p. 835-845, 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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14. | | PINTO, F. G. da S.; CHUEIRE, L. M. de O.; VASCONCELOS, A. T. R.; NICOLÁS, M. F.; GONZAGA, L.; SOUZA, R. C.; HUNGRIA, M. Panorama genômico e bioprospecção de genes de Rhizobium tropici estirpe PRF 81 (SEMIA 4080) utilizada em inoculantes comerciais para a cultura do feijoeiro. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 27.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 11.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 9.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 6., 2006, Bonito, MS. A busca das raízes: anais. Dourados: Embrapa Agropecuária Oeste, 2006. 1 CD-ROM. (Embrapa Agropecuária Oeste. Documentos, 82).Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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15. | | GODOY, L. P.; CHUEIRE, L. M. de O.; BARCELLOS, F. G.; VASCONCELOS, A. T. R.; GONZAGA, L. de P.; NICOLÁS, M. F.; HUNGRIA, M. Panorama genômico da estirpe de Bradyrhizobium japonicum CPAC 15, recomendada para o uso em inoculantes comerciais para a cultura da soja. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 2005, Londrina. Resumos expandidos. Londrina: Embrapa Soja, 2005. p. 98-103. (Embrapa Soja. Documentos, 268).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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16. | | GODOY, L. P.; CHUEIRE, L. M. de O.; BARCELLOS, F. G.; VASCONCELOS, A. T. R.; GONZAGA, L. de P.; NICOLÁS, M. F; SOUZA, R. C.; HUNGRIA, M. Panorama genômico da estirpe de Bradyrhizobium japonicum CPAC 15, recomendada para o uso em inoculantes comerciais para a cultura da soja. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 2., 2006, Londrina. Resumos expandidos. Londrina: Embrapa Soja, 2006. p. 156-161. (Embrapa Soja. Documentos, 276).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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17. | | GODOY, L. P.; CHUEIRE, L. M. de O.; BARCELLOS, F. G.; VASCONCELOS, A. T. R.; GONZAGA, L. de P.; NÍCOLAS, M. F.; SOUZA, R. C.; HUNGRIA, M. Panorama genômico da estirpe SEMIA 5079 (=CPAC 15) de Bradyrhizobium japonicum, recomendada para inoculantes comerciais na cultura da soja. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 27.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 11.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 9.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 6., 2006, Bonito, MS. A busca das raízes: anais. Dourados: Embrapa Agropecuária Oeste, 2006. 1 CD-ROM. (Embrapa Agropecuária Oeste. Documentos, 82).Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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18. | | PINTO, F. G. da S.; CHUEIRE, L. M. de O.; VASCONCELOS, A. T. R.; NICOLÁS, M. F.; GONZAGA, L.; ANDRE, E.; HUNGRIA, M. Panorama genômico de Rhizobium tropici estirpe PRF 81 (Semia 4080). In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 2005, Londrina. Resumos expandidos. Londrina: Embrapa Soja, 2005. p. 50-55. (Embrapa Soja. Documentos, 268).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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20. | | BABUJIA, L. C.; SILVA, A. P.; NAKATANI, A. S.; CANTAO, M. E.; VASCONCELOS, A. T. R.; VISENTAINER, J. V.; HUNGRIA, M. Impact of long-term cropping of glyphosate-resistant transgenic soybean [Glycine max (L.) Merr.] on soil microbiome. Transgenic Research, Feb., p.1-6, 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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